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1. NCBI RefSeq

编号样例：NM_025011， NR_130915.1， NR_130915

  1. “NM_”, “XM_” ： 编号的首字母常为 N 或者 X ，N 表示该数据是通过实验验证的，X 表示的是该数据是未经实验证实，通过生物信息学方法计算预测出的。

  2. “NR_”, “NP_”, “NM_”：编号的第二各字母常为 R，P，M 表示该数据的类型。含义见下表

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前言

最近在学习生存分析，为了防止自己忘记常见的生存分析步骤以及 survival 包中的一些函数用法，故于此记录。
本篇文章以 survival 包中的内置数据集为例，介绍生存分析的一般步骤，如有错误请在评论区指出。

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仅用于记录

按下 Alt + Ctrl + F1/F2.../F12 打开任意一个非图形终端

用 ps -t tty1 查找各用户上运行的进程，需要找一个Xrog的进程，该进程只在加载了图形桌面的用户上有，一般是 tty2, tty1, tty7 这么几个，找到后 记下 Xrog 的 进程号(PID)

然后杀死该进程 kill PID，系统会自动重启该进程

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生存分析

生存分析的概念与作用

生存分析指的是根据调查或者实验得到的数据对样本的寿命进行分析和推断的一个分析过程。生存分析的结果往往是一幅以时间为横坐标，以生存概率为纵坐标的二维散点/折线图。其中每一个散点代表的是样本总体生存到某一时间点的概率。如下图所示。

生存分析结果图

生存分析的结果可以用于比较两组样本谁对研究对象有更好的寿命延长或减少效果。

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秩和检验

一、秩和检验的作用

秩和检验主要用于检验两个独立的样本的总体分布是不是相同。跟 t 检验类似，只不过秩和检验对于样本总体的要求不高，t 检验往往要求样本的总体分布符合正态分布。而秩和检验是在总体分布不符合正态或者总体分布不确定时使用的一种非参数性检验。

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秩和检验

一、秩和检验的作用

秩和检验主要用于检验两个独立的样本的总体分布是不是相同。跟 t 检验类似，只不过秩和检验对于样本总体的要求不高，t 检验往往要求样本的总体分布符合正态分布。而秩和检验是在总体分布不符合正态或者总体分布不确定时使用的一种非参数性检验。

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Delong检验

一、Delong检验的作用

用于比较两个ROC曲线的性能，Delong检验是用于AUC面积的显著性检验的。如果两个模型的AUC大小有异但是没有通过Delong检验，那么也不能说明这两个模型有显著的不同。

总之，Delong检验就是一种统计学上用于检验AUC显著性的检验方法。

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