DAVID富集分析(二)
1.原始数据为从DAVID进行富集分析结束后download下的txt文件。
2.下载txt文件后用 本文件夹 中的R代码改写相应工作目录即可画出通路富集的气泡图。
3.结果如图所示
4.横轴Fold Enrichmment表示实际富集到的概率比随机富集到的概率多了多少倍
计算公式:
Count / List.Total = 实际富集到的概率i
Pop.Hits / Pop.Total = 随机富集到的概率ii
i / ii = Fold Enrichment